18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4393 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2502    99.92 
 
 		 1273 bp  2367    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4393    100 
 
 		 1240 bp  2458    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2598    80.72 
 
 		 1184 bp  153  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4190    88.76 
 
 		 435 bp  97.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  85.29 
 
 		 1239 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  85.29 
 
 		 1239 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  85.29 
 
 		 1239 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  87.84 
 
 		 1257 bp  75.8  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 921 bp  73.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3175  transposase, IS4  88.24 
 
 		 141 bp  71.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  87.5 
 
 		 897 bp  71.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  88.24 
 
 		 1308 bp  71.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  88.24 
 
 		 1299 bp  71.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1089  transposase, IS4  80.92 
 
 		 1173 bp  61.9  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4227  transposase, IS4  85.14 
 
 		 1299 bp  60  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6980    94.59 
 
 		 144 bp  58  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6788    96.67 
 
 		 1313 bp  52  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617764  normal  0.368676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02590  hypothetical protein  94.12 
 
 		 1230 bp  52  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>