16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2502 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2502    100 
 
 		 1273 bp  2524    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4393    99.92 
 
 		 1240 bp  2367    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2598    80.72 
 
 		 1184 bp  153  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4190    86.89 
 
 		 435 bp  115  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  85.71 
 
 		 1239 bp  113  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  85.71 
 
 		 1239 bp  113  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  85.71 
 
 		 1239 bp  113  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  85.71 
 
 		 1257 bp  95.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  83.7 
 
 		 897 bp  93.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1089  transposase, IS4  81.66 
 
 		 1173 bp  89.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4227  transposase, IS4  84.82 
 
 		 1299 bp  87.7  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3175  transposase, IS4  85.44 
 
 		 141 bp  85.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  85.29 
 
 		 1299 bp  83.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  85.29 
 
 		 1308 bp  83.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6980    83.19 
 
 		 144 bp  77.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6788    96.67 
 
 		 1313 bp  52  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617764  normal  0.368676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>