10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0060 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0060  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0418927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0053  tRNA-Gln  95.89 
 
 		 75 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30190  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.548182  normal  0.107034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26560  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000051562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0053  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.355739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0011  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42458  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0044  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0920336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0041  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646474  normal  0.266593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0041  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0010  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.632292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>