25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1928 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1928  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  437  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  42.52 
 
 
212 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  40.36 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  34.38 
 
 
433 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  28.23 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  25.22 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  25.22 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  25.25 
 
 
243 aa  55.1  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  28.22 
 
 
224 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  28.48 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  25.46 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  25.23 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  23.08 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  24.89 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  24.77 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  25.37 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  38.64 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  25.37 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  26.09 
 
 
219 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  26.94 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  25.23 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  24.38 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  24.89 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  23.27 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  24.79 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>