17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1714 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1714  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 152 aa  290  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.400974  normal  0.677106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1783  paraquat-inducible protein A  58.39 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.266349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1065  paraquat-inducible protein A  61.42 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1120  paraquat-inducible protein A  62.2 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2457  hypothetical protein  62.2 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0535929  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2128  hypothetical protein  54.48 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.401537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  34.11 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  27.66 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  27.94 
 
 		 220 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 423 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  24.64 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  28.68 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  26.77 
 
 		 247 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4710  hypothetical protein  27.86 
 
 		 230 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3953  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 211 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4068  hypothetical protein  29.29 
 
 		 211 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>