17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1442 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1442  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 373 aa  751    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2520  ATP dependent DNA ligase  52.65 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1102  ATP dependent DNA ligase  49.32 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0970  hypothetical protein  38.74 
 
 		 390 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0300  ATP dependent DNA ligase  40.3 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0656  ATP dependent DNA ligase  32.35 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000244761  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0534  ATP dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1758  ATP dependent DNA ligase  37.14 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0896981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1374  ATP dependent DNA ligase  32.1 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000452083 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1262  ATP dependent DNA ligase  31.25 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1364  ATP dependent DNA ligase  30.99 
 
 		 392 aa  206  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.787891  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0982  ATP dependent DNA ligase  36.59 
 
 		 367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2553  ATP dependent DNA ligase  32.29 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0198928  normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1908  ATP dependent DNA ligase  30.15 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1413  ATP-dependent DNA ligase  30.33 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  30.54 
 
 		 232 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  29.89 
 
 		 235 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>