12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0519 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0519  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2299  hypothetical protein  82.3 
 
 
209 aa  357  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281266  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1665  hypothetical protein  56.94 
 
 
208 aa  241  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3464  hypothetical protein  57.89 
 
 
207 aa  236  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.9 
 
 
425 aa  174  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162956  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0281  chromosome partitioning ATPase  42.27 
 
 
447 aa  150  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0808  KaiC-like transcriptional regulator  40.09 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.105234  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0180  hypothetical protein  31.44 
 
 
300 aa  92.4  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.445273  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0101  hypothetical protein  22.84 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0267  hypothetical protein  26.76 
 
 
221 aa  45.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.583033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  22.5 
 
 
459 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  31.36 
 
 
452 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>