12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1552 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1552  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  283  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1254  hypothetical protein  85.19 
 
 
136 aa  237  4e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3114  hypothetical protein  79.26 
 
 
137 aa  228  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2836  hypothetical protein  77.78 
 
 
137 aa  222  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3355  hypothetical protein  74.63 
 
 
137 aa  219  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.811536  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2667  putative transcriptional regulator  54.01 
 
 
136 aa  150  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3257  putative transcriptional regulator  50 
 
 
134 aa  131  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0161  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 
158 aa  83.6  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3159  hypothetical protein  34.48 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.614847 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4321  hypothetical protein  28.69 
 
 
212 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  43.33 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  41.82 
 
 
182 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>