11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0556 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0556  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  250  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  38.3 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  43.04 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  40.51 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  40.79 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  37.97 
 
 
122 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  36.71 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  35.44 
 
 
125 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  37.18 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  35.06 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  37.65 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>