18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05720 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05720  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
161 aa  315  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.443895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  28.48 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  24.55 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  27.61 
 
 
563 aa  67.8  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  27.03 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  25.62 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  30.07 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  28.48 
 
 
268 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0957  PRC-barrel domain protein  24.83 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  23.03 
 
 
248 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  23.42 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  24.32 
 
 
347 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3061  hypothetical protein  28 
 
 
268 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2588  PRC-barrel domain protein  22.75 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000158516  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  23.49 
 
 
259 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  23.75 
 
 
250 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0465  hypothetical protein  31.65 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000637262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  26.32 
 
 
349 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>