16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6168 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6168  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  333  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807131  decreased coverage  0.00427364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4358  cobalamin B12-binding domain protein  54.17 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554272  normal  0.47471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2951  methylaspartate mutase subunit S  47.69 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872778  normal  0.0119232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2980  methylaspartate mutase subunit S  33.33 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  32.56 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  32.56 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  29.55 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  33.94 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  32.11 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  33.03 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  29.85 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2791  methylaspartate mutase, S subunit  31.33 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  31.19 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  29.01 
 
 		 363 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  30.28 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3405  methylaspartate mutase, E subunit  28.24 
 
 		 646 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.70543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>