15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5588 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5588  protein of unknown function DUF324  100 
 
 		 331 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  25.85 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  27.88 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  28.34 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  29.73 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  23.61 
 
 		 294 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  27.59 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  26.32 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  27.97 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  34.31 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  21.19 
 
 		 260 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  25.99 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  25.53 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  26.36 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  37.78 
 
 		 670 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>