15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1379 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1379  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  616  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3094  conserved hypothetical conserved membrane protein  44.44 
 
 
309 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.592106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0657  hypothetical protein  36.59 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0957  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.11 
 
 
320 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1108  hypothetical protein  35.02 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62512  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1413  hypothetical protein  32.44 
 
 
323 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1773  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.600035  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  24.64 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3621  hypothetical protein  31.25 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356841 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  21.79 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  24.44 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4197  hypothetical protein  40 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  33.96 
 
 
347 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  33.02 
 
 
347 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  33.02 
 
 
347 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>