84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0400 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  192  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3952  hypothetical protein  41.57 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2022  hypothetical protein  38.2 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1831  hypothetical protein  39.33 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.860734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1041  hypothetical protein  38.04 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1594  Fatty acid synthesis plsX protein  38.64 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000298358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0015  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2862  hypothetical protein  37.36 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0415789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2513  hypothetical protein  39.33 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195334  normal  0.450057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44140  hypothetical protein  40.45 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4248  hypothetical protein  40.45 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2498  hypothetical protein  36.67 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1620  hypothetical protein  40.45 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3754  hypothetical protein  39.33 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3567  hypothetical protein  40.45 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1547  hypothetical protein  38.64 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3497  hypothetical protein  39.56 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0308826  normal  0.95157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29860  hypothetical protein  37.08 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.640265  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0270  hypothetical protein  40.66 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02857  hypothetical protein  34.07 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3814  hypothetical protein  39.33 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2532  hypothetical protein  39.77 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000943  hypothetical protein  35.48 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.597764  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0656  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0820  hypothetical protein  38.64 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740993  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3522  protein of unknown function DUF1255  36.26 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0560507  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06952  hypothetical protein  34.41 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3112  hypothetical protein  34.83 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3590  protein of unknown function DUF1255  36.26 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.3016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3196  hypothetical protein  35.11 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310619  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2921  hypothetical protein  34.83 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.412619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0489  hypothetical protein  34.78 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1700  hypothetical protein  34.41 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00119422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3241  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436368  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00342  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3668  hypothetical protein  34.88 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0418  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0421  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0308  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3217  protein of unknown function DUF1255  31.52 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0465  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00338  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0429  hypothetical protein  33.7 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.897795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0428  hypothetical protein  33.7 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0835  hypothetical protein  34.09 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0447  hypothetical protein  33.7 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.219742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0434  hypothetical protein  33.7 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0861  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128749  hitchhiker  0.0000846912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0281  hypothetical protein  31.58 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0862  hypothetical protein  32.61 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325253  normal  0.891406 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3142  hypothetical protein  31.52 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.496899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3292  hypothetical protein  31.52 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.739881  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3281  hypothetical protein  31.52 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1187  protein of unknown function DUF1255  32.22 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0389162 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3424  hypothetical protein  31.18 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.310921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3074  protein of unknown function DUF1255  30 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2227  hypothetical protein  32.22 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000123767  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1752  hypothetical protein  32.95 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0748694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1026  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.596759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3312  hypothetical protein  31.46 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0998  hypothetical protein  31.46 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0273  hypothetical protein  28.09 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0761  protein of unknown function DUF1255  28.09 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.827861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1951  protein of unknown function DUF1255  26.97 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1328  hypothetical protein  30.34 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0273  hypothetical protein  28.09 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0265  hypothetical protein  28.09 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3029  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.249045  normal  0.859497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0323  hypothetical protein  28.72 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0338978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0269  protein of unknown function DUF1255  28.09 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1472  hypothetical protein  28.95 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1848  hypothetical protein  32.22 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.711654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4838  hypothetical protein  26.44 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4467  hypothetical protein  26.6 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1508  protein of unknown function DUF1255  30.34 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1778  hypothetical protein  27.78 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0253213  normal  0.0734741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1534  hypothetical protein  28.09 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1338  hypothetical protein  25.84 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.73825e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2672  protein of unknown function DUF1255  32.98 
 
 		 107 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3759  hypothetical protein  26.6 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0262  hypothetical protein  26.6 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0379  hypothetical protein  29.67 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1707  hypothetical protein  32.22 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224011  hitchhiker  0.00197735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0263  hypothetical protein  25.53 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000961266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>