10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0021 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0043  tRNA-Ala  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0809108  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>