13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2828 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2828  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 692 aa  1430    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3567  transposase IS4 family protein  77.34 
 
 		 687 aa  1079    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3793  transposase IS4 family protein  45.19 
 
 		 628 aa  488  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209171  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2942  transposase IS4 family protein  30.02 
 
 		 558 aa  201  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  27.73 
 
 		 369 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3154  hypothetical protein  26.46 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1891  hypothetical protein  37.36 
 
 		 135 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.092595 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0047  transposase  24.56 
 
 		 228 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000399191  normal  0.0497457 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3062  transposase IS4 family protein  36 
 
 		 584 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3440  hypothetical protein  35.96 
 
 		 311 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1353  transposase IS4 family protein  37.31 
 
 		 370 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1988  transposase  27.19 
 
 		 216 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.676841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  22.82 
 
 		 415 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>