20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1027 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1027  DoxX family protein  100 
 
 
174 aa  347  5e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.662698 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0371  DoxX family protein  71.84 
 
 
174 aa  268  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167599  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2462  DoxX family protein  71.84 
 
 
174 aa  268  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.984431  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3491  DoxX family protein  40.51 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0083  DoxX family protein  35.62 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0953  DoxX family protein  36.17 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.661535  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  35.2 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0768  hypothetical protein  27.1 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123691  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4469  hypothetical protein  27.1 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000117454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4431  hypothetical protein  27.1 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4197  DoxX family protein  27.1 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4482  hypothetical protein  27.1 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4247  hypothetical protein  26.45 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000990049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3072  DoxX family protein  26.32 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4578  hypothetical protein  26.45 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.413157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4096  hypothetical protein  26.45 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000575667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  27.51 
 
 
184 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0082  TQO small subunit DoxD  29.49 
 
 
164 aa  41.6  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000522418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4430  hypothetical protein  25.81 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4085  hypothetical protein  25.81 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.62393e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>