61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2173 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2173  Slp family outer membrane lipoprotein  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2420  outer membrane lipoprotein Slp  52.94 
 
 
181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.0108754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0667  outer membrane lipoprotein, Slp family  46.99 
 
 
185 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1325  Outer membrane lipoprotein Slp  39.46 
 
 
171 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2348  outer membrane lipoprotein, Slp family  43.53 
 
 
190 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1619  Outer membrane lipoprotein Slp  42.36 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2806  Slp family outer membrane lipoprotein  36 
 
 
198 aa  101  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0323453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1992  outer membrane lipoprotein, Slp family  43.42 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2260  Slp family outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1817  Slp family outer membrane lipoprotein  33.1 
 
 
189 aa  98.2  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2011  outer membrane lipoprotein, Slp family  40.76 
 
 
205 aa  97.8  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1572  putative outer membrane lipoprotein Slp  34.3 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2230  outer membrane lipoprotein, Slp family  38.51 
 
 
207 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0678986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1429  Outer membrane lipoprotein Slp  37.5 
 
 
190 aa  94.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00755368  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0543  Slp family outer membrane lipoprotein  34.97 
 
 
165 aa  94.4  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2207  outer membrane lipoprotein Slp  33.33 
 
 
183 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1963  outer membrane protein Slp  35.98 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01135  Starvation-inducible outer membrane lipoprotein  29.81 
 
 
218 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004092  starvation lipoprotein Slp like protein  31.06 
 
 
185 aa  92  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1956  outer membrane lipoprotein Slp  37.32 
 
 
178 aa  92  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202475  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2316  outer membrane lipoprotein Slp, putative  37.32 
 
 
178 aa  92  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.884572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1382  outer membrane protein Slp  36.59 
 
 
193 aa  92  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.387794  normal  0.55237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1894  outer membrane protein Slp  36.59 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2032  outer membrane protein Slp  36.59 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1837  outer membrane lipoprotein, Slp family  36.59 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126443  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1312  outer membrane protein Slp  35.37 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0266673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2020  outer membrane protein Slp  35.37 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.251668  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1959  outer membrane protein Slp  35.37 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2066  outer membrane protein Slp  36.07 
 
 
193 aa  91.3  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1497  outer membrane protein Slp  35.37 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0668  outer membrane lipoprotein Slp  41.79 
 
 
165 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2376  Slp family outer membrane lipoprotein  33.89 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01377  hypothetical protein  30.12 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02439  outer membrane protein Slp  41.4 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01764  hypothetical protein  35.98 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.736998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01776  predicted lipoprotein  35.98 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.994959  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1827  Slp family outer membrane lipoprotein  34.78 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64405  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2533  outer membrane protein Slp  35.98 
 
 
193 aa  89  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31032  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0861  outer membrane lipoprotein Slp  34.55 
 
 
175 aa  89  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2347  outer membrane lipoprotein Slp  37.41 
 
 
155 aa  88.2  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.831306  normal  0.890388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1935  outer membrane lipoprotein, Slp family  39.23 
 
 
214 aa  87  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0908  outer membrane lipoprotein, Slp family  40 
 
 
185 aa  84.3  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3107  putative starvation-inducible outer membrane lipoprotein  33.56 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2419  outer membrane lipoprotein Slp  40.91 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0101966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2761  Slp family outer membrane lipoprotein  37.18 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000231326  hitchhiker  0.00115108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2184  Slp family outer membrane lipoprotein  34.04 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03307  hypothetical protein  32.39 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0211  Slp family outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4854  outer membrane lipoprotein, Slp family  32.39 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3904  outer membrane lipoprotein, Slp family  32.39 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3799  Slp family outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3992  Slp family outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3708  Slp family outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00034327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03354  outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0208  outer membrane lipoprotein, Slp family  32.39 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2057  outer membrane lipoprotein Slp  31.21 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000642718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2126  Slp family outer membrane lipoprotein  36.49 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2404  Slp family outer membrane lipoprotein  36.49 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000394448  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2015  Slp family outer membrane lipoprotein  36.51 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000421651  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2172  outer membrane lipoprotein Slp  35.17 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1119  outer membrane lipoprotein Slp  36 
 
 
107 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>