14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1998 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1998  phasin family protein  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00664406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0331  hypothetical protein  48.45 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0613  phasin family protein  36.13 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000122223  hitchhiker  0.0000006864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1111  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0831089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2464  hypothetical protein  31.43 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.24765  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2600  hypothetical protein  27.03 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000170743  decreased coverage  0.0000068876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1804  hypothetical protein  29.9 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0496455  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000518  hypothetical protein  30.39 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05367  hypothetical protein  29.41 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0547  hypothetical protein  26.42 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000170743  hitchhiker  0.000247294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  30.84 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  30.61 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  31.54 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>