12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2464 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2464  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  296  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.24765  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0629  hypothetical protein  40.32 
 
 
115 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000518  hypothetical protein  37.9 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05367  hypothetical protein  37.9 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0331  hypothetical protein  40.45 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1998  phasin family protein  30.65 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00664406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1751  phasin family protein  27.72 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.420801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0613  phasin family protein  28.85 
 
 
172 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000122223  hitchhiker  0.0000006864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1804  hypothetical protein  28.81 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0496455  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1111  hypothetical protein  27.19 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0831089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2600  hypothetical protein  25.26 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000170743  decreased coverage  0.0000068876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0547  hypothetical protein  30.14 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000170743  hitchhiker  0.000247294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>