16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1718 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  32.75 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  29.78 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  31.13 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  33.97 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  34.29 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  27.92 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  34.21 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.46 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  28.19 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25.38 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  26.18 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>