More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0864 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0864  PhoH family protein  100 
 
 
397 aa  808    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0596  phosphate starvation-inducible protein  60.27 
 
 
391 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.427062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1750  PhoH family protein  46.36 
 
 
376 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224703  normal  0.417547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13470  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  44.19 
 
 
353 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17250  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  44.39 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.465991  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2206  PhoH family protein  56.92 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  64.93 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11730  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  42.97 
 
 
346 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2232  PhoH family protein  61.3 
 
 
362 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00260346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  63.68 
 
 
333 aa  280  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  60.81 
 
 
322 aa  278  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  57.92 
 
 
335 aa  277  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  62.74 
 
 
319 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3453  PhoH family protein  43.5 
 
 
380 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1969  PhoH family protein  60.87 
 
 
362 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000703344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1576  PhoH family protein  63.81 
 
 
355 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0922563  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3832  PhoH family protein  44.57 
 
 
329 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  63.03 
 
 
348 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2188  PhoH family protein  57.49 
 
 
345 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3387  PhoH family protein  64.29 
 
 
375 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  63.21 
 
 
319 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  63.21 
 
 
319 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  62.74 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  62.74 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  62.74 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  62.74 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  62.74 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  62.74 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  50.51 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  62.74 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  44.65 
 
 
333 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1912  PhoH family protein  61.61 
 
 
345 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4627  PhoH family protein  42.89 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  62.74 
 
 
319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  56.9 
 
 
328 aa  272  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7049  PhoH family protein  61.82 
 
 
393 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  59.17 
 
 
325 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  63.64 
 
 
320 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  58.53 
 
 
345 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1658  PhoH family protein  62.38 
 
 
376 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  59.91 
 
 
316 aa  270  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  61.4 
 
 
353 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  62.02 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  60.83 
 
 
361 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0777  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  57.73 
 
 
330 aa  270  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  52.82 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2706  PhoH family protein  57.83 
 
 
353 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  62.38 
 
 
354 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1156  PhoH family protein  53.73 
 
 
340 aa  269  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  59.91 
 
 
381 aa  269  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  61.68 
 
 
349 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2048  PhoH family protein  62.91 
 
 
323 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  57.39 
 
 
357 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  61.23 
 
 
350 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  59.24 
 
 
320 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  63.16 
 
 
359 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  57.39 
 
 
357 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3456  PhoH-like protein  57.39 
 
 
319 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1546  PhoH family protein  60 
 
 
350 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  52.38 
 
 
318 aa  267  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0986  PhoH family protein  50.96 
 
 
318 aa  266  5e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  62.02 
 
 
340 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  61.43 
 
 
345 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1401  PhoH family protein  58.26 
 
 
322 aa  265  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.100499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  62.32 
 
 
340 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  61.14 
 
 
354 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1285  PhoH family protein  58.26 
 
 
322 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129158  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12394  phoH-like protein phoH1 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  61.43 
 
 
352 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  61.43 
 
 
340 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  60.66 
 
 
332 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  51.4 
 
 
319 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  51.1 
 
 
352 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  56.71 
 
 
323 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  61.24 
 
 
336 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  57.27 
 
 
347 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  60.66 
 
 
332 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  60.66 
 
 
332 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  60.95 
 
 
334 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1653  phoH family protein  58.18 
 
 
332 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  57.33 
 
 
328 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  63.11 
 
 
323 aa  263  4.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  60.09 
 
 
326 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  61.43 
 
 
340 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  60.29 
 
 
328 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  58.94 
 
 
327 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3159  PhoH family protein  61.65 
 
 
343 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00307849  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  58.94 
 
 
327 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  52.03 
 
 
319 aa  262  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  43.16 
 
 
323 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  58.53 
 
 
365 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  64.39 
 
 
359 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1184  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  59.62 
 
 
319 aa  261  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0986  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  57.78 
 
 
328 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00869262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  59.15 
 
 
322 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  60.39 
 
 
368 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  57.99 
 
 
348 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  60.19 
 
 
332 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  62.2 
 
 
315 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  58.22 
 
 
342 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  41.28 
 
 
351 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>