16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4341 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2893  hypothetical protein  53.04 
 
 
115 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000100997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  37.72 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  37.72 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2402  hypothetical protein  40.23 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000157501  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2513  hypothetical protein  43.22 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00274394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1167  hypothetical protein  39.66 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1706  hypothetical protein  44.07 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0633e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1722  hypothetical protein  41.44 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  32.67 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  48.78 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  33.03 
 
 
115 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  46.34 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  33 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  33 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0805  hypothetical protein  34.88 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000446183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>