19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3133 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  357  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2208  putative lipoprotein  50.57 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0752  hypothetical protein  51.3 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0767  hypothetical protein  51.95 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2299  putative lipoprotein  41.72 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.340663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1414  hypothetical protein  35.03 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000639051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2115  lipoprotein, putative  34.12 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1732  putative lipoprotein  34.5 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2437  hypothetical protein  32.02 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2085  hypothetical protein  26.9 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.025196  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1638  hypothetical protein  26.44 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1999  hypothetical protein  28.49 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000126346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0727  hypothetical protein  31.09 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0156781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  27.48 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2060  hypothetical protein  27.16 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0313  hypothetical protein  23.81 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0202  hypothetical protein  24.59 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0056  hypothetical protein  22.09 
 
 		 192 aa  44.3  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0125376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2729  hypothetical protein  22.81 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>