11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2108 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2108  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  357  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3442  hypothetical protein  48.28 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.6631e-29 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0869  proline-rich region  43.75 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.426723  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2597  hypothetical protein  41.18 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0152  proline-rich region  60 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0285  hypothetical protein  60.98 
 
 		 111 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00144128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0233  hypothetical protein  69.23 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.86465e-19  hitchhiker  8.74497e-18 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3535  hypothetical protein  56.67 
 
 		 108 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0147192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0536  hypothetical protein  47.83 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0476  hypothetical protein  58.06 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2916  hypothetical protein  36.17 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>