24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0798 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  627  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  31.08 
 
 
276 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  32.25 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  30.51 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  31.08 
 
 
288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  31.99 
 
 
304 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  29.86 
 
 
303 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0566  hypothetical protein  30 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00656687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  26.62 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  29.52 
 
 
274 aa  85.9  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02980  hypothetical protein  27.44 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  25.26 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  22.26 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  24.27 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  24.83 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1612  hypothetical protein  24.73 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  23.08 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6234  hypothetical protein  27.08 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4716  hypothetical protein  24.92 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.428888  normal  0.0726517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0027  hypothetical protein  26.94 
 
 
259 aa  59.3  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6250  hypothetical protein  23.94 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2029  hypothetical protein  24.76 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.721418  normal  0.623981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2026  hypothetical protein  23.46 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121874  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0028  w0044  45.83 
 
 
66 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>