54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4288 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  551  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  57.14 
 
 
281 aa  268  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  41.48 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  46.31 
 
 
232 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  41.12 
 
 
322 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  38.51 
 
 
434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  38.51 
 
 
434 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
402 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  34.47 
 
 
218 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  36 
 
 
382 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  28.72 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  30.23 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  30.96 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  30.54 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  33.76 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  31.29 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  34.73 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  35.25 
 
 
143 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1527  hypothetical protein  28.34 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  34.42 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  31.02 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  30.77 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  30.54 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  27.61 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  52.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  28.29 
 
 
240 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  28.49 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  25.45 
 
 
236 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  27.49 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  27.14 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2182  macrocin-O-methyltransferase  34.19 
 
 
166 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  33.33 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3930  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.85 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0551  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  33.33 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.53 
 
 
882 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  29.55 
 
 
316 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3359  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.43 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13053  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14461  hypothetical protein  24.82 
 
 
241 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0529  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  32.43 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5242  hypothetical protein  30.47 
 
 
254 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.019453  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  28.97 
 
 
557 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  31.88 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5644  hypothetical protein  30.6 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2419  macrocin-O-methyltransferase  33.03 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1855  glycosyltransferase-like protein  34.13 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  26.58 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1328  bacteriocin O-metyltransferase, putative  25 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  25 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1261  macrocin O-methyltransferase  25 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1116  macrocin-O-methyltransferase  25 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1290  putative bacteriocin O-metyltransferase  25 
 
 
281 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.133264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1366  putative bacteriocin O-metyltransferase  25 
 
 
281 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1103  O-methyltransferase  25 
 
 
281 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1109  O-methyltransferase  25 
 
 
281 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>