25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3411 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  72.66 
 
 
141 aa  202  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  64.75 
 
 
139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  64.75 
 
 
139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  64.75 
 
 
139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  64.54 
 
 
139 aa  178  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  65.47 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  66.15 
 
 
134 aa  170  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  60 
 
 
140 aa  168  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  62.31 
 
 
134 aa  161  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  61.83 
 
 
136 aa  156  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  62.31 
 
 
137 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  60.63 
 
 
131 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  57.25 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  55.73 
 
 
134 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  58.97 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  55.56 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  51.82 
 
 
142 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  55.22 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  43.33 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  34.58 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  51.43 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1703  hypothetical protein  44.68 
 
 
286 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.735506  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  54.84 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>