18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1322 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1322  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  538  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0348  hypothetical protein  46.84 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0810  hypothetical protein  42.95 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0562  hypothetical protein  44.65 
 
 
336 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0052  hypothetical protein  44.08 
 
 
289 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01410  hypothetical protein  33.04 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4233  hypothetical protein  36.84 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2993  hypothetical protein  38.62 
 
 
198 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  30.77 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  52.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  26.11 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  27.53 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  25.79 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  25.79 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  28.65 
 
 
197 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3877  hypothetical protein  29.5 
 
 
178 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  27.54 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>