9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1284 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1284    100 
 
 
324 bp  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2897    83.13 
 
 
832 bp  186  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  84.11 
 
 
824 bp  182  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  82.82 
 
 
833 bp  178  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  82.82 
 
 
833 bp  178  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  82.82 
 
 
833 bp  178  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1187    81.04 
 
 
518 bp  85.7  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2894    89.16 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.09152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0350  succinate CoA transferase  100 
 
 
1515 bp  46.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0236116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>