11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3557 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3557  putative lipoprotein  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3462  putative lipoprotein  70.33 
 
 		 246 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4425  hypothetical protein  58.09 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0060  hypothetical protein  60.5 
 
 		 245 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22132e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0077  hypothetical protein  59.66 
 
 		 245 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000844228  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3619  putative lipoprotein  47.33 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0935  putative lipoprotein  41.53 
 
 		 239 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1926  putative lipoprotein  44.16 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2428  putative lipoprotein  43.83 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000405062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1584  hypothetical protein  38.18 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0011  hypothetical protein  27.4 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0855925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>