12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2299 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2299  putative lipoprotein  100 
 
 		 175 aa  357  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.340663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2208  putative lipoprotein  56.58 
 
 		 176 aa  188  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  41.72 
 
 		 172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0752  hypothetical protein  39.49 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0767  hypothetical protein  38.22 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1414  hypothetical protein  33.76 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000639051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2115  lipoprotein, putative  31.74 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1732  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2437  hypothetical protein  30.25 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0313  hypothetical protein  22.09 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  28.04 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5918  hypothetical protein  29.86 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>