21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1436 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  905    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1007  hypothetical protein  75.3 
 
 		 386 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.450732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  44.92 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  45.15 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  75 
 
 		 120 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  29.81 
 
 		 480 aa  106  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  28 
 
 		 480 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  25.97 
 
 		 503 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  25.78 
 
 		 512 aa  87  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  24.74 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  23.74 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  23.74 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  24.17 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  41.38 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  41.38 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  41.96 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  33.04 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  30.63 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  31.82 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  35.25 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  29.91 
 
 		 543 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>