28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3673 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  76.26 
 
 		 198 aa  296  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.69 
 
 		 197 aa  260  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 		 204 aa  150  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  33.65 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.57 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.67 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  32.47 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.37 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  29.8 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.13 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  32.32 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  29.65 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  32.23 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  43.01 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  26.18 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  29.59 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  32.64 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  29.09 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  40.98 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  37.66 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  29.81 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.5 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.44 
 
 		 449 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>