22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0444 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0444  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 360 aa  749    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3328  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  61 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.703732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0344  hypothetical protein  58.93 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0687151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2369  hypothetical protein  43.61 
 
 		 413 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1676  hypothetical protein  37.58 
 
 		 410 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2104  hypothetical protein  39.34 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1035  hypothetical protein  33.12 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0477  hypothetical protein  31.82 
 
 		 435 aa  180  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2261  hypothetical protein  34.06 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2265  hypothetical protein  29.87 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0678841  normal  0.713238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1978  hypothetical protein  31.38 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0514587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2096  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  34.1 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.735031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02430  hypothetical protein  25.16 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0596996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00460  hypothetical protein  26.12 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1990  hypothetical protein  20.83 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1273  putative periplasmic solute-binding protein  45.45 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384428  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  46.67 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.73 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  43.18 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>