11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0374 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  176  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  43.75 
 
 		 82 aa  87  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  45.68 
 
 		 95 aa  85.5  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  45 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  46.58 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  43.24 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  41.86 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  38.1 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  31.71 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  29.63 
 
 		 85 aa  48.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  36.14 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>