32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0651 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0651    100 
 
 
479 bp  950    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297133 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  85.54 
 
 
267 bp  69.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  85.54 
 
 
267 bp  69.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  85.54 
 
 
267 bp  69.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  91.49 
 
 
267 bp  61.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  92.68 
 
 
267 bp  58  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  92.68 
 
 
267 bp  58  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  92.68 
 
 
267 bp  58  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  92.68 
 
 
267 bp  58  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  89.36 
 
 
267 bp  54  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  89.36 
 
 
267 bp  54  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  89.36 
 
 
267 bp  54  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  89.36 
 
 
267 bp  54  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    89.36 
 
 
1992 bp  54  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0637  transposase IS3/IS911  94.29 
 
 
267 bp  54  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 
267 bp  48.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2926  transposase IS3/IS911  88.64 
 
 
201 bp  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 
267 bp  48.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 
267 bp  48.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 
267 bp  48.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    91.43 
 
 
2455 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  91.43 
 
 
1118 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1395  hypothetical protein  93.55 
 
 
354 bp  46.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>