23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0242 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0242  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  174  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2194  hypothetical protein  44.32 
 
 
93 aa  86.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2118  hypothetical protein  53.42 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0196  hypothetical protein  48.65 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645997  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0597  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.733421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0536  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5581  hypothetical protein  44.57 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3648  hypothetical protein  43.48 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0542195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4719  hypothetical protein  43.48 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1057  hypothetical protein  43.48 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0342986  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4111  hypothetical protein  43.59 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3976  hypothetical protein  41.46 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425175  normal  0.0185965 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4576  hypothetical protein  41.3 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616061  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1060  hypothetical protein  48.28 
 
 
60 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0954839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4509  hypothetical protein  43.24 
 
 
102 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4351  hypothetical protein  41.25 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4640  hypothetical protein  31.82 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4328  hypothetical protein  31.82 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3944  formate dehydrogenase H  31.82 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3909  formate dehydrogenase H  31.82 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4547  hypothetical protein  30.68 
 
 
91 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5591  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6553  hypothetical protein  37.97 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>