17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4874 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013442  Gbro_4874  hypothetical protein  100 
 
 
626 aa  1241    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5535  hypothetical protein  27.99 
 
 
457 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.439091 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5937  hypothetical protein  27.99 
 
 
457 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252857  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5393  cutinase  32.2 
 
 
335 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147295 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5100  cutinase  31.82 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.802756  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5012  cutinase  31.82 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5642  cutinase  32.4 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1167  cutinase  30.59 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13836  hypothetical protein  31.38 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.353538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0212  hypothetical protein  31.17 
 
 
337 aa  73.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0170  hypothetical protein  28.19 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0171  cutinase precursor  26.99 
 
 
313 aa  58.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0475  PE-PPE domain-containing protein  33.68 
 
 
251 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  hitchhiker  0.00338535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0124  cutinase  24.43 
 
 
296 aa  50.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17200  Cutinase  28.18 
 
 
423 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1403  hypothetical protein  29.17 
 
 
323 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.663711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1515  cutinase  29.41 
 
 
241 aa  45.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0782878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>