More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3715 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  24.24 
 
 
7214 aa  736    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  28.41 
 
 
3770 aa  925    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.830211 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  24.76 
 
 
6919 aa  842    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  32.7 
 
 
5328 aa  1374    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  27.48 
 
 
2894 aa  1089    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  32.4 
 
 
3470 aa  1337    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  34.1 
 
 
2174 aa  930    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.52 
 
 
4317 aa  1077    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.6 
 
 
3291 aa  1308    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.98 
 
 
5953 aa  1782    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.61 
 
 
6889 aa  1988    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.16 
 
 
2385 aa  1107    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.54 
 
 
4336 aa  1100    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33.18 
 
 
2151 aa  952    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  30.13 
 
 
3168 aa  953    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  31.78 
 
 
5929 aa  1491    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.5 
 
 
3432 aa  1444    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.93 
 
 
4531 aa  1694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.19 
 
 
2385 aa  1109    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  25.19 
 
 
2345 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.5 
 
 
2385 aa  1123    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  33.52 
 
 
2385 aa  1122    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  28.24 
 
 
6404 aa  1109    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  33.2 
 
 
3328 aa  1035    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  31.24 
 
 
4186 aa  795    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.37 
 
 
3021 aa  977    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  30.93 
 
 
4336 aa  1102    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  34.23 
 
 
2154 aa  952    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  30.5 
 
 
3165 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  31.87 
 
 
5926 aa  1510    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.18 
 
 
9498 aa  1708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  30.99 
 
 
5372 aa  1385    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  29.67 
 
 
5469 aa  966    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.58 
 
 
13537 aa  1815    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.34 
 
 
6676 aa  1784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.74 
 
 
3629 aa  917    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  28.35 
 
 
2867 aa  718    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  27.7 
 
 
2791 aa  782    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.06 
 
 
3308 aa  1533    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  31.83 
 
 
3498 aa  1072    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.6 
 
 
2033 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.47 
 
 
8646 aa  1100    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  31.39 
 
 
6274 aa  1252    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  30.91 
 
 
4239 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  32.02 
 
 
6072 aa  1602    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  32.53 
 
 
4572 aa  1508    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  30.46 
 
 
3291 aa  1059    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  31.35 
 
 
6272 aa  1244    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.68 
 
 
4502 aa  1045    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  30.57 
 
 
2136 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  30.64 
 
 
5422 aa  1212    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.4 
 
 
4882 aa  1599    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  31.26 
 
 
3002 aa  1011    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.21 
 
 
4332 aa  1105    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  29.68 
 
 
4383 aa  1235    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  36.15 
 
 
1726 aa  742    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.19 
 
 
2385 aa  1109    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  30.99 
 
 
4037 aa  814    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12405  peptide synthetase mbtE  33.33 
 
 
1731 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.517103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  35.14 
 
 
6999 aa  1051    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  33.73 
 
 
5620 aa  1030    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  37.07 
 
 
4290 aa  1821    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  36.75 
 
 
4489 aa  2058    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  34.58 
 
 
2605 aa  874    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  30.39 
 
 
3102 aa  1050    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  33.42 
 
 
8914 aa  1687    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  26.68 
 
 
3395 aa  687    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  24.81 
 
 
3137 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27.14 
 
 
2457 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.02 
 
 
2138 aa  869    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  30.62 
 
 
3348 aa  1069    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  33.78 
 
 
5230 aa  990    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.72 
 
 
4317 aa  1095    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  32.28 
 
 
4468 aa  1490    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  33.24 
 
 
2187 aa  878    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  33.28 
 
 
3176 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  27.13 
 
 
3114 aa  716    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.85 
 
 
2352 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.2 
 
 
4342 aa  1070    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  32.33 
 
 
5149 aa  865    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  34.31 
 
 
2189 aa  994    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  35.23 
 
 
2448 aa  1065    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  34.3 
 
 
3524 aa  1321    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  25.17 
 
 
2410 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  33.79 
 
 
2386 aa  1133    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  30.53 
 
 
2151 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.07 
 
 
4342 aa  1069    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  35.08 
 
 
2512 aa  679    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  29.01 
 
 
2391 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.48 
 
 
8915 aa  1194    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0169  thioester reductase domain-containing protein  29.01 
 
 
2391 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.15 
 
 
6081 aa  1593    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  39.6 
 
 
1449 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  32.53 
 
 
5467 aa  798    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  30.46 
 
 
2199 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  35.39 
 
 
4991 aa  1077    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  33.23 
 
 
3352 aa  1039    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  31.93 
 
 
3962 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.21 
 
 
2370 aa  989    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  31.33 
 
 
6271 aa  1248    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>