15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2511 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2511  hypothetical protein  100 
 
 
511 aa  1028    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  52.87 
 
 
496 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0865  hypothetical protein  52.95 
 
 
480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0882  hypothetical protein  52.95 
 
 
480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0871  hypothetical protein  52.74 
 
 
480 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  52.19 
 
 
485 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  26.43 
 
 
502 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  25.21 
 
 
489 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  24.17 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  22 
 
 
492 aa  61.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  24 
 
 
490 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  24.06 
 
 
515 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  23.86 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  28.51 
 
 
487 aa  43.9  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  21.5 
 
 
510 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>