36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1496 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1496  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 
291 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  28.63 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  26.32 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  26.03 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  32.45 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  32.45 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  32.45 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  22.88 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  29.96 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  24.15 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  28.51 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  24.56 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  25.2 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  25.44 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  31.78 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  35.66 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  27.39 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  23.33 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  26.37 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  25.78 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  26.25 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  27.89 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  27.89 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  27.89 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  25.71 
 
 
281 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  27.2 
 
 
267 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  25.73 
 
 
315 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  26.14 
 
 
290 aa  49.7  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  25.48 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  25.2 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  21.89 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  24.81 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  29.65 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10481  conserved hypothetical protein  24.81 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00162641  normal  0.337442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  26.54 
 
 
302 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>