10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0066 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0549  hypothetical protein  40.65 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2559  hypothetical protein  29.47 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  36.09 
 
 		 2914 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3614  Forkhead-associated protein  38.38 
 
 		 835 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158405  hitchhiker  0.00251691 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  31.62 
 
 		 2035 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.56 
 
 		 1888 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  36.54 
 
 		 1079 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  41.18 
 
 		 1008 aa  42  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  34.23 
 
 		 2851 aa  41.6  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>