17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3395 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3395  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.204524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3458  hypothetical protein  97.7 
 
 		 87 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0880  hypothetical protein  77.01 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3197  hypothetical protein  73.56 
 
 		 87 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0081  hypothetical protein  70.11 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3436  hypothetical protein  71.26 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0483  hypothetical protein  63.22 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00824867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2949  hypothetical protein  54.65 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1957  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.596295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2466  hypothetical protein  48.84 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.637451  normal  0.208992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1902  hypothetical protein  52.27 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0511709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1977  hypothetical protein  51.14 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2062  hypothetical protein  51.14 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2217  response regulator  46.43 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0760  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 367 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0668721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0745  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 375 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>