More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2217 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2217  response regulator  100 
 
 		 316 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  41.21 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0745  response regulator receiver protein  42.54 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0760  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0668721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  33.11 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0720  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  35.07 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  32.14 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  33.82 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0081  hypothetical protein  45.33 
 
 		 87 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 128 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  35.58 
 
 		 458 aa  67  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  33.61 
 
 		 414 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 163 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 523 aa  66.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  34.45 
 
 		 663 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  30.2 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  33.07 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  33.07 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.14 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  31.41 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  31.41 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  33.07 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.14 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  33.6 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.62 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.06 
 
 		 711 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  32.45 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  32.84 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  32.84 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  34.62 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  33.06 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  33.06 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  31.09 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1559 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.43 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  35.29 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.29 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  28.93 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  32.23 
 
 		 123 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  37.19 
 
 		 1334 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3436  hypothetical protein  43.94 
 
 		 87 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.16 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  38.46 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1105  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  31.71 
 
 		 1366 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  28.48 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.09 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  33.61 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  32.07 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  31.78 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  29.84 
 
 		 705 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0930  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 456 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139996  normal  0.100238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2540  response regulator  30.25 
 
 		 192 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1806  alkaline phosphatase synthesis response regulator  35.59 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000153503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 121 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  33.61 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  33.61 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.75 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  32.26 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0880  hypothetical protein  47.46 
 
 		 87 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292454  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 576 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>