More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0745 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0745  response regulator receiver protein  100 
 
 		 375 aa  757    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0760  response regulator receiver protein  95.1 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0668721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  47.55 
 
 		 324 aa  326  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2217  response regulator  42.54 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0922  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0918  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0873  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 483 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0633299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4015  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 124 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2046  response regulator  32.65 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  30.77 
 
 		 460 aa  72.8  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.73 
 
 		 2284 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0955  response regulator receiver domain-containing protein  32.69 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 121 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 503 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  31.62 
 
 		 2301 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 122 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  31.71 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  37.07 
 
 		 123 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  25.96 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4336  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1149  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0930  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139996  normal  0.100238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  31.73 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4204  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4132  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  29.2 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27.54 
 
 		 1956 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 242 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 163 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.48 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.48 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.4 
 
 		 2336 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2810  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 127 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2486  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 121 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1609 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1530  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2686  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000608002 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 129 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  30.7 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  31.2 
 
 		 1834 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1487  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 123 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  30.77 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0978  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.41 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97362  decreased coverage  0.00116316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.78 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.46 
 
 		 224 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 566 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 224 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 132 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  28.97 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 576 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  33.96 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.84 
 
 		 306 aa  67  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.67 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  32.69 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1069  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0511705  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.17 
 
 		 454 aa  66.2  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  22.16 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.52 
 
 		 1992 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.58 
 
 		 1960 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 1758 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>