31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3340 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3340  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 386 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0906  class II aldolase/adducin family protein  93.26 
 
 		 385 aa  728    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58056e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3265  class II aldolase/adducin family protein  73.44 
 
 		 389 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2288  class II aldolase/adducin-like  73.3 
 
 		 391 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00052721  normal  0.0891696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2190  class II aldolase and adducin N-terminal domain-containing protein  72.21 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1876  class II aldolase/adducin family protein  41.34 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000546395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1249  L-fuculose phosphate aldolase  37.78 
 
 		 189 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1355  class II aldolase/adducin family protein  36.11 
 
 		 191 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0389357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2210  L-fuculose phosphate aldolase  32.22 
 
 		 183 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000461155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1450  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.571414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1385  L-fuculose phosphate aldolase  33.85 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.190215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1027  L-fuculose phosphate aldolase  32.62 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1641  L-fuculose phosphate aldolase  32.26 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.515005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1523  aldolase, class II  31.72 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.854462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0314  L-fuculose phosphate aldolase  29.14 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  30.86 
 
 		 180 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3173  L-fuculose phosphate aldolase  30.51 
 
 		 178 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  29.67 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1037  class II aldolase/adducin family protein  30.48 
 
 		 185 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.093036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  28.14 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  30.73 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  29.32 
 
 		 214 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0823  class II aldolase/adducin family protein  22.96 
 
 		 196 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  25.84 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  27.98 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  23.83 
 
 		 227 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  30.86 
 
 		 225 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  30.3 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  23.12 
 
 		 230 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.1 
 
 		 212 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  26.55 
 
 		 209 aa  42.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>