14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2513 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2513  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  229  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00274394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1706  hypothetical protein  97.46 
 
 		 118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0633e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2893  hypothetical protein  64.41 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000100997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1167  hypothetical protein  53.85 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2402  hypothetical protein  50.43 
 
 		 116 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000157501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  43.22 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1722  hypothetical protein  41.74 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  39.62 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  38.68 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  32.35 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  31.73 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  26.47 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  26.47 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  34.25 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>