29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2458 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  93.39 
 
 		 378 aa  717    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 378 aa  764    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  59.63 
 
 		 376 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  57.03 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  44.39 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  42.63 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  39.34 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 		 366 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  37.54 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  40.44 
 
 		 350 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 		 360 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  31.46 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  22.42 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  25.07 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  32.41 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.67 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  26.77 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>