20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1528 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2688  hypothetical protein  96.3 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000329796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1796  hypothetical protein  75 
 
 		 137 aa  177  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00914712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2048  hypothetical protein  57.02 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000179688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  52.68 
 
 		 114 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2488  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  35.77 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0597  hypothetical protein  29.46 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3456  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  24.56 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0839  hypothetical protein  26.32 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0331682  normal  0.920191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  24.56 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  24.35 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3673  hypothetical protein  22.73 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  26.28 
 
 		 397 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  23.68 
 
 		 340 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3543  hypothetical protein  25.64 
 
 		 365 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.571666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  22.81 
 
 		 340 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  26.28 
 
 		 395 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  25.44 
 
 		 340 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>